Apoiar projetos de pesquisa que visem contribuir significativamente para o desenvolvimento científico, tecnológico e a inovação do país, nas seguintes áreas prioritárias:
a) Recuperação e monitoramento de ecossistemas amazônicos;
b) Biotecnologia;
c) Geração de energia renovável;
d) Sistemas alimentares sustentáveis;
e) Adaptação e mitigação à mudança climática;
f) Educação, cultura, povos e saberes tradicionais;
g) Gestão de recursos hídricos;
h) Saúde da população Amazônica;
i) Tecnologias sociais;
j) Soluções de inteligência artificial aplicada aos desafios da Região Amazônica;
k) Integração regional Amazônica;
l) Cadeias produtivas da sociobiodiversidade Amazônica;
m) Mineração na Amazônia.

Apoiar projetos visando o fortalecimento do Programa de Excelência em Pesquisa Internacional da Casa de Oswaldo Cruz (PROEP-INTER 2025) de forma a aumentar ou induzir iniciativas de colaboração internacional em pesquisa científica e desenvolvimento tecnológico com instituições de Portugal, promovendo a criação de novas linhas de investigação, estimulando a cooperação entre especialistas, pesquisadores, tecnologistas, pesquisadores visitantes e discentes de programas de pós-graduação das instituições envolvidas, além de parcerias com outras Unidades da Fiocruz e instituições de ensino e pesquisa afins.

Apoiar projetos de pesquisa que visem contribuir significativamente para o desenvolvimento científico e tecnológico e a inovação do País, por meio da concessão de bolsas no País em todas as áreas do conhecimento.