O processo de acompanhamento e avaliação (A&A) tem sido aperfeiçoado a fim de mensurar, sempre que possível, as características exigidas dos núcleos de excelência. Para tanto, a Coordenação do PRONEX no CNPq criou uma base de dados sobre os projetos, o SINEX. Posteriormente o SIGEF, a Plataforma Lattes, e o Prossiga, bases de dados vinculadas ao CNPq, tiveram suas informações cruzadas com a base do Programa a fim de produzir estatísticas e consolidar indicadores. O resultado desse trabalho se encontra em documentos denominados Dados Agregados, disponíveis abaixo.

Os dados indicam que os pesquisadores doutores apoiados pelo PRONEX têm um índice agregado de produtividade cerca de 66% acima da média de todos os doutores presentes no Diretório de Grupos de Pesquisa do CNPq.

Dados Agregados do Edital 1996

Parte I: Informações Gerais
Parte II: Dados das equipes PRONEX
Parte III: Dados de produção e produtividade

Dados Agregados: Editais 1996, 1997 e 1998

Parte I: Informações Gerais
Parte II: Dados das equipes PRONEX
Parte III: Dados de produção e produtividade